Noin 10 vuotta ensimmäisen BioShockin jälkeen Rapturen käytävät kaikuvat jälleen kerran menneisyyden synneistä. Atlantin rannikolla hirviö on vanginnut tyttöjä ja vienyt heidät Rapturen maanalaiseen kaupunkiin. Astu yhden Rapturen ikonisimman asukkaan, Big Daddyn, kenkiin. Tutki kaunista, rappeutuvaa kaupunkia ja seuraa tuntemattoman vihollisen jälkiä etsiessäsi vastauksia ja omaa selviytymistäsi.
